- o -

• octaEnergy() : McMd::GroupRebridgeBase
• open() : McMd::DCDTrajectoryReader , McMd::DdMdTrajectoryReader , McMd::LammpsDumpReader , McMd::TrajectoryReader , Util::FileMaster
• openControlFile() : Util::FileMaster
• openFile() : ParamFileTest , UnitTest
• openInputFile() : UnitTest , Util::FileMaster
• openOutputFile() : UnitTest , Util::FileMaster
• openRestartIFile() : Util::FileMaster
• openRestartOFile() : Util::FileMaster
• operator double() : Util::Rational
• operator&() : Util::BinaryFileIArchive , Util::BinaryFileOArchive , Util::MemoryCounter , Util::MemoryIArchive , Util::MemoryOArchive , Util::TextFileIArchive , Util::TextFileOArchive , Util::XdrFileIArchive , Util::XdrFileOArchive
• operator()() : Util::Ar1Process , Util::CardinalBSpline , Util::GridArray< Data > , Util::IFunctor< T > , Util::IFunctor< void > , Util::Matrix< Data > , Util::MethodFunctor< Object, T > , Util::MethodFunctor< Object, void > , Util::MTRand_int32 , Util::Polynomial< T > , Util::RaggedMatrix< Data > , Util::SymmTensorAverage , Util::Tensor , Util::TensorAverage
• operator*() : Util::ArrayIterator< Data > , Util::ConstArrayIterator< Data > , Util::ConstPArrayIterator< Data > , Util::FlexPtr< T > , Util::ListIterator< Data > , Util::PArrayIterator< Data > , Util::ScopedPtr< T >
• operator*=() : Util::IntVector , Util::Polynomial< T > , Util::Rational , Util::Tensor , Util::Vector
• operator++() : DdMd::PairIterator , McMd::PairIterator , Util::ArrayIterator< Data > , Util::ConstArrayIterator< Data > , Util::ConstPArrayIterator< Data > , Util::ListIterator< Data > , Util::PArrayIterator< Data >
• operator+=() : Util::IntVector , Util::Polynomial< T > , Util::Rational , Util::Tensor , Util::Vector
• operator--() : Util::ListIterator< Data >
• operator-=() : Util::IntVector , Util::Polynomial< T > , Util::Rational , Util::Tensor , Util::Vector
• operator->() : Util::ArrayIterator< Data > , Util::ConstArrayIterator< Data > , Util::ConstPArrayIterator< Data > , Util::FlexPtr< T > , Util::ListIterator< Data > , Util::PArrayIterator< Data > , Util::ScopedPtr< T >
• operator/=() : Util::Polynomial< T > , Util::Rational , Util::Tensor , Util::Vector
• operator<<() : Util::BinaryFileOArchive , Util::MemoryCounter , Util::MemoryOArchive , Util::TextFileOArchive , Util::XdrFileOArchive
• operator=() : DdMd::Atom , Simp::BoxExternal , Simp::CosineAngle , Simp::CosineDihedral , Simp::CosineSqAngle , Simp::DpdPair , Simp::EwaldInteraction , Simp::FeneBond , Simp::GeneralPeriodicExternal , Simp::HarmonicAngle , Simp::HarmonicBond , Simp::HarmonicL0Bond , Simp::LamellarOrderingExternal , Simp::LJPair , Simp::LocalLamellarOrderingExternal , Simp::MultiHarmonicDihedral , Simp::NucleationExternal , Simp::OrthoBoxExternal , Simp::PeriodicExternal , Simp::SimplePeriodicExternal , Simp::SlitExternal , Simp::SphericalTabulatedExternal , Util::DArray< Data > , Util::Distribution , Util::DMatrix< Data > , Util::DPArray< Data > , Util::DSArray< Data > , Util::FArray< Data, Capacity > , Util::FMatrix< Data, M, N > , Util::FPArray< Data, Capacity > , Util::FSArray< Data, Capacity > , Util::GArray< Data > , Util::GPArray< Data > , Util::GridArray< Data > , Util::GStack< Data > , Util::IntDistribution , Util::IntVector , Util::MemoryIArchive , Util::MTRand_int32 , Util::PointSymmetry , Util::Polynomial< T > , Util::RadialDistribution , Util::Rational , Util::RingBuffer< Data > , Util::Setable< T > , Util::SSet< Data, Capacity > , Util::SymmetryGroup< Symmetry > , Util::Tensor , Util::Vector
• operator>>() : Util::BinaryFileIArchive , Util::MemoryIArchive , Util::TextFileIArchive , Util::XdrFileIArchive
• operator[]() : DdMd::Mask , Util::Array< Data > , Util::CardinalBSpline , Util::DSArray< Data > , Util::FArray< Data, Capacity > , Util::FPArray< Data, Capacity > , Util::FSArray< Data, Capacity > , Util::GArray< Data > , Util::GridArray< Data > , Util::IntVector , Util::ListArray< Data > , Util::Manager< Data > , Util::PArray< Data > , Util::RingBuffer< Data > , Util::SSet< Data, Capacity > , Util::SymmetryGroup< Symmetry > , Util::Vector
• OptionalLabel() : Util::OptionalLabel
• OrderParamNucleation() : DdMd::OrderParamNucleation
• OrthoBoxExternal() : Simp::OrthoBoxExternal
• OrthoRegion() : Simp::OrthoRegion
• OrthorhombicBoundary() : Simp::OrthorhombicBoundary
• output() : DdMd::Analyzer , DdMd::AnalyzerManager , DdMd::AutoCorrAnalyzer< Data, Product > , DdMd::AverageAnalyzer , DdMd::EnergyAnalyzer , DdMd::ExternalEnergyAverage , DdMd::OrderParamNucleation , DdMd::PairEnergyAverage , DdMd::StressAutoCorr , DdMd::StructureFactor , DdMd::StructureFactorGrid , DdMd::SymmTensorAverageAnalyzer , DdMd::TensorAverageAnalyzer , DdMd::TrajectoryWriter , DdMd::VanHove , DdMd::VirialStressTensorAverage , McMd::Analyzer , McMd::AnalyzerManager , McMd::AtomMSD , McMd::AverageAnalyzer< SystemType > , McMd::BennettsMethod , McMd::BlockRadiusGyration , McMd::BondLengthDist , McMd::BoundaryAverage , McMd::CfbReptateMove , McMd::CfbReptationMove , McMd::ClusterHistogram , McMd::ComMSD , McMd::CompositionProfile , McMd::EndtoEnd , McMd::EndtoEndXYZ , McMd::G1MSD , McMd::InterIntraLink , McMd::IntraBondStressAutoCorr< SystemType > , McMd::IntraBondTensorAutoCorr< SystemType > , McMd::IntraPairAutoCorr , McMd::IntraStructureFactor , McMd::IntraStructureFactorGrid , McMd::LammpsDumpWriter , McMd::LinearRouseAutoCorr , McMd::LinkLengthDist , McMd::LinkLifeTime , McMd::LinkLTPos , McMd::LinkMSD , McMd::McEnergyAnalyzer , McMd::McEnergyOutput , McMd::McMove , McMd::McMoveManager , McMd::McMuExchange , McMd::McNVTChemicalPotential , McMd::McPairEnergyAverage , McMd::McVirialStressTensorAverage , McMd::MdEnergyAnalyzer , McMd::MdEnergyOutput , McMd::MdKineticEnergyAverage , McMd::MdPairEnergyCoefficients , McMd::MdPotentialEnergyAverage , McMd::MdVirialStressTensorAverage , McMd::NLinkAverage , McMd::PerturbDerivative , McMd::PressureAverage< SystemType > , McMd::RadiusGyration , McMd::RDF , McMd::RingRouseAutoCorr , McMd::SemiGrandDistribution , McMd::SSChainDist , McMd::StressAutoCorr< SystemType > , McMd::StressTensorAverage< SystemType > , McMd::StructureFactor , McMd::StructureFactorGrid , McMd::StructureFactorP , McMd::StructureFactorPGrid , McMd::TrajectoryWriter , McMd::TypeDistribution , McMd::VanHove , McMd::VelProf , Tools::Analyzer , Tools::AnalyzerManager , Tools::AtomMSD , Tools::LogStep , Tools::PairEnergy , Tools::TrajectoryWriter , Util::AutoCorr< Data, Product > , Util::AutoCorrArray< Data, Product > , Util::AutoCorrStage< Data, Product > , Util::Average , Util::Distribution , Util::IntDistribution , Util::MeanSqDispArray< Data > , Util::RadialDistribution
• OutputBoxdim() : DdMd::OutputBoxdim
• OutputEnergy() : DdMd::OutputEnergy
• outputFileName() : DdMd::Analyzer , McMd::Analyzer , Tools::Analyzer
• outputOptions() : DdMd::Simulation , McMd::Simulation
• OutputPairEnergies() : DdMd::OutputPairEnergies
• OutputPressure() : DdMd::OutputPressure
• outputStatistics() : DdMd::AtomStorage , DdMd::Buffer , DdMd::Exchanger , DdMd::GroupStorage< N > , DdMd::Integrator , DdMd::PairList
• OutputStressTensor() : DdMd::OutputStressTensor
• OutputTemperature() : DdMd::OutputTemperature
• ownerRank() : DdMd::Domain