Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:
- o -
- OArchive
: Util::Serializable
- octaEnergy()
: McMd::GroupRebridgeBase
- OffsetArray
: DdMd::Cell
, Tools::Cell
- OffSetArrayCapacity
: DdMd::Cell
- oldPos_
: McMd::CfbEndMove
, McMd::CfbLinearEndMove
, McMd::CfbRebridgeMove
, McMd::CfbRingRebridgeMove
- open()
: McMd::DCDTrajectoryReader
, McMd::DdMdTrajectoryReader
, McMd::LammpsDumpReader
, McMd::TrajectoryReader
, Util::FileMaster
- openControlFile()
: Util::FileMaster
- openFile()
: ParamFileTest
, UnitTest
- openInputFile()
: UnitTest
, Util::FileMaster
- openOutputFile()
: UnitTest
, Util::FileMaster
- openRestartIFile()
: Util::FileMaster
- openRestartOFile()
: Util::FileMaster
- operator double()
: Util::Rational
- operator!=
: Util::PointSymmetry
- operator&()
: Util::BinaryFileIArchive
, Util::BinaryFileOArchive
, Util::MemoryCounter
, Util::MemoryIArchive
, Util::MemoryOArchive
, Util::TextFileIArchive
, Util::TextFileOArchive
, Util::XdrFileIArchive
, Util::XdrFileOArchive
- operator()()
: Util::Ar1Process
, Util::CardinalBSpline
, Util::GridArray< Data >
, Util::IFunctor< T >
, Util::IFunctor< void >
, Util::Matrix< Data >
, Util::MethodFunctor< Object, T >
, Util::MethodFunctor< Object, void >
, Util::MTRand_int32
, Util::Polynomial< T >
, Util::RaggedMatrix< Data >
, Util::SymmTensorAverage
, Util::Tensor
, Util::TensorAverage
- operator*()
: Util::ArrayIterator< Data >
, Util::ConstArrayIterator< Data >
, Util::ConstPArrayIterator< Data >
, Util::FlexPtr< T >
, Util::ListIterator< Data >
, Util::PArrayIterator< Data >
, Util::PointSymmetry
, Util::Rational
, Util::ScopedPtr< T >
- operator*=()
: Util::IntVector
, Util::Polynomial< T >
, Util::Rational
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator+
: Util::Rational
- operator++()
: DdMd::PairIterator
, McMd::PairIterator
, Util::ArrayIterator< Data >
, Util::ConstArrayIterator< Data >
, Util::ConstPArrayIterator< Data >
, Util::ListIterator< Data >
, Util::PArrayIterator< Data >
- operator+=()
: Util::IntVector
, Util::Polynomial< T >
, Util::Rational
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator-
: Util::Rational
- operator--()
: Util::ListIterator< Data >
- operator-=()
: Util::IntVector
, Util::Polynomial< T >
, Util::Rational
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator->()
: Util::ArrayIterator< Data >
, Util::ConstArrayIterator< Data >
, Util::ConstPArrayIterator< Data >
, Util::FlexPtr< T >
, Util::ListIterator< Data >
, Util::PArrayIterator< Data >
, Util::ScopedPtr< T >
- operator/
: Util::Rational
- operator/=()
: Util::Polynomial< T >
, Util::Rational
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator<<
: DdMd::AtomType
, DdMd::Group< N >
, DdMd::Plan
, McMd::AtomType
, McMd::PairSelector
, Simp::MonoclinicBoundary
, Simp::OrthorhombicBoundary
, Simp::SpeciesGroup< NAtom >
, Tools::Species
, Util::BinaryFileOArchive
, Util::Bool
, Util::Dbl
, Util::Int
, Util::IntVector
, Util::Label
, Util::Lng
, Util::MemoryCounter
, Util::MemoryOArchive
, Util::PointGroup
, Util::PointSymmetry
, Util::Rational
, Util::Str
, Util::Tensor
, Util::TextFileOArchive
, Util::Vector
, Util::XdrFileOArchive
- operator=()
: DdMd::Atom
, Simp::BoxExternal
, Simp::CosineAngle
, Simp::CosineDihedral
, Simp::CosineSqAngle
, Simp::DpdPair
, Simp::EwaldInteraction
, Simp::FeneBond
, Simp::GeneralPeriodicExternal
, Simp::HarmonicAngle
, Simp::HarmonicBond
, Simp::HarmonicL0Bond
, Simp::LamellarOrderingExternal
, Simp::LJPair
, Simp::LocalLamellarOrderingExternal
, Simp::MultiHarmonicDihedral
, Simp::NucleationExternal
, Simp::OrthoBoxExternal
, Simp::PeriodicExternal
, Simp::SimplePeriodicExternal
, Simp::SlitExternal
, Simp::SphericalTabulatedExternal
, Util::DArray< Data >
, Util::Distribution
, Util::DMatrix< Data >
, Util::DPArray< Data >
, Util::DSArray< Data >
, Util::FArray< Data, Capacity >
, Util::FMatrix< Data, M, N >
, Util::FPArray< Data, Capacity >
, Util::FSArray< Data, Capacity >
, Util::GArray< Data >
, Util::GPArray< Data >
, Util::GridArray< Data >
, Util::GStack< Data >
, Util::IntDistribution
, Util::IntVector
, Util::MemoryIArchive
, Util::MTRand_int32
, Util::PointSymmetry
, Util::Polynomial< T >
, Util::RadialDistribution
, Util::Rational
, Util::RingBuffer< Data >
, Util::Setable< T >
, Util::SSet< Data, Capacity >
, Util::SymmetryGroup< Symmetry >
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator==
: Util::IntVector
, Util::PointSymmetry
, Util::Rational
, Util::Tensor
, Util::Vector
- operator>>
: DdMd::AtomType
, DdMd::Group< N >
, DdMd::Plan
, McMd::AtomType
, McMd::PairSelector
, Simp::MonoclinicBoundary
, Simp::OrthorhombicBoundary
, Simp::SpeciesGroup< NAtom >
, Tools::Species
, Util::BinaryFileIArchive
, Util::Bool
, Util::Dbl
, Util::Int
, Util::IntVector
, Util::Label
, Util::Lng
, Util::MemoryIArchive
, Util::Str
, Util::Tensor
, Util::TextFileIArchive
, Util::Vector
, Util::XdrFileIArchive
- operator[]()
: DdMd::Mask
, Util::Array< Data >
, Util::CardinalBSpline
, Util::DSArray< Data >
, Util::FArray< Data, Capacity >
, Util::FPArray< Data, Capacity >
, Util::FSArray< Data, Capacity >
, Util::GArray< Data >
, Util::GridArray< Data >
, Util::IntVector
, Util::ListArray< Data >
, Util::Manager< Data >
, Util::PArray< Data >
, Util::RingBuffer< Data >
, Util::SSet< Data, Capacity >
, Util::SymmetryGroup< Symmetry >
, Util::Vector
- OptionalLabel()
: Util::OptionalLabel
- OrderParamNucleation()
: DdMd::OrderParamNucleation
- OrthoBoxExternal()
: Simp::OrthoBoxExternal
- OrthoRegion()
: Simp::OrthoRegion
- OrthorhombicBoundary()
: Simp::OrthorhombicBoundary
- output()
: DdMd::Analyzer
, DdMd::AnalyzerManager
, DdMd::AutoCorrAnalyzer< Data, Product >
, DdMd::AverageAnalyzer
, DdMd::EnergyAnalyzer
, DdMd::ExternalEnergyAverage
, DdMd::OrderParamNucleation
, DdMd::PairEnergyAverage
, DdMd::StressAutoCorr
, DdMd::StructureFactor
, DdMd::StructureFactorGrid
, DdMd::SymmTensorAverageAnalyzer
, DdMd::TensorAverageAnalyzer
, DdMd::TrajectoryWriter
, DdMd::VanHove
, DdMd::VirialStressTensorAverage
, McMd::Analyzer
, McMd::AnalyzerManager
, McMd::AtomMSD
, McMd::AverageAnalyzer< SystemType >
, McMd::BennettsMethod
, McMd::BlockRadiusGyration
, McMd::BondLengthDist
, McMd::BoundaryAverage
, McMd::CfbReptateMove
, McMd::CfbReptationMove
, McMd::ClusterHistogram
, McMd::ComMSD
, McMd::CompositionProfile
, McMd::EndtoEnd
, McMd::EndtoEndXYZ
, McMd::G1MSD
, McMd::InterIntraLink
, McMd::IntraBondStressAutoCorr< SystemType >
, McMd::IntraBondTensorAutoCorr< SystemType >
, McMd::IntraPairAutoCorr
, McMd::IntraStructureFactor
, McMd::IntraStructureFactorGrid
, McMd::LammpsDumpWriter
, McMd::LinearRouseAutoCorr
, McMd::LinkLengthDist
, McMd::LinkLifeTime
, McMd::LinkLTPos
, McMd::LinkMSD
, McMd::McEnergyAnalyzer
, McMd::McEnergyOutput
, McMd::McMove
, McMd::McMoveManager
, McMd::McMuExchange
, McMd::McNVTChemicalPotential
, McMd::McPairEnergyAverage
, McMd::McVirialStressTensorAverage
, McMd::MdEnergyAnalyzer
, McMd::MdEnergyOutput
, McMd::MdKineticEnergyAverage
, McMd::MdPairEnergyCoefficients
, McMd::MdPotentialEnergyAverage
, McMd::MdVirialStressTensorAverage
, McMd::NLinkAverage
, McMd::PerturbDerivative
, McMd::PressureAverage< SystemType >
, McMd::RadiusGyration
, McMd::RDF
, McMd::RingRouseAutoCorr
, McMd::SemiGrandDistribution
, McMd::SSChainDist
, McMd::StressAutoCorr< SystemType >
, McMd::StressTensorAverage< SystemType >
, McMd::StructureFactor
, McMd::StructureFactorGrid
, McMd::StructureFactorP
, McMd::StructureFactorPGrid
, McMd::TrajectoryWriter
, McMd::TypeDistribution
, McMd::VanHove
, McMd::VelProf
, Tools::Analyzer
, Tools::AnalyzerManager
, Tools::AtomMSD
, Tools::LogStep
, Tools::PairEnergy
, Tools::TrajectoryWriter
, Util::AutoCorr< Data, Product >
, Util::AutoCorrArray< Data, Product >
, Util::AutoCorrStage< Data, Product >
, Util::Average
, Util::Distribution
, Util::IntDistribution
, Util::MeanSqDispArray< Data >
, Util::RadialDistribution
- OutputBoxdim()
: DdMd::OutputBoxdim
- OutputEnergy()
: DdMd::OutputEnergy
- outputFile_
: DdMd::OrderParamNucleation
, DdMd::StructureFactor
, DdMd::VanHove
, McMd::AverageAnalyzer< SystemType >
, McMd::CompositionProfile
, McMd::IntraStructureFactor
, McMd::StructureFactor
, McMd::StructureFactorP
- outputFileName()
: DdMd::Analyzer
, McMd::Analyzer
, Tools::Analyzer
- outputFileName_
: McMd::Analyzer
- outputOptions()
: DdMd::Simulation
, McMd::Simulation
- OutputPairEnergies()
: DdMd::OutputPairEnergies
- OutputPressure()
: DdMd::OutputPressure
- outputStatistics()
: DdMd::AtomStorage
, DdMd::Buffer
, DdMd::Exchanger
, DdMd::GroupStorage< N >
, DdMd::Integrator
, DdMd::PairList
- OutputStressTensor()
: DdMd::OutputStressTensor
- OutputTemperature()
: DdMd::OutputTemperature
- ownerRank()
: DdMd::Domain