Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

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• IArchive : Util::Serializable
• iBlock() : Util::Average , Util::SymmTensorAverage , Util::TensorAverage
• id() : DdMd::Atom , DdMd::AtomType , DdMd::Cell , DdMd::Group< N > , McMd::Atom , McMd::AtomType , McMd::Cluster , McMd::Molecule , McMd::System , Simp::Species , Tools::Atom , Tools::Cell , Tools::Group< N > , Tools::Molecule , Tools::Species , Tools::TypeMap
• id_ : Simp::Species
• identifyClusters() : McMd::ClusterIdentifier
• identity() : Util::PointSymmetry , Util::SymmetryGroup< Symmetry > , Util::Tensor
• Identity : Util::Tensor
• Im : Util::Constants
• impropers() : Tools::Configuration
• incrementCapacity() : DdMd::Cell , Tools::Cell
• incrementNAccept() : McMd::McMove
• incrementNAttempt() : McMd::McMove
• incrementPairStress() : DdMd::Potential
• incrementSendSize() : DdMd::Buffer
• indent() : Util::ParamComponent
• index() : Util::ArraySet< Data > , Util::SSet< Data, Capacity >
• indexInMolecule() : McMd::Atom
• init() : Util::Ar1Process , Util::XdrFileIArchive , Util::XdrFileOArchive
• initDynamicalState() : DdMd::Integrator , DdMd::NphIntegrator , DdMd::NptIntegrator , DdMd::NvtIntegrator
• initFactory() : Util::Manager< Data >
• initialize() : DdMd::AtomStorage , DdMd::Cell , DdMd::GroupStorage< N > , DdMd::PairPotential , McMd::ClusterIdentifier , McMd::PairList , Tools::Cell , Tools::Species , Util::List< Data >
• initializeAtomGroupIdArrays() : Simp::Species
• initialParameter_ : McMd::Perturbation
• initStatic() : DdMd::Analyzer , DdMd::AtomType , DdMd::Modifier , McMd::Analyzer , McMd::Atom , Util::Constants , Util::Format , Util::IntVector , Util::Log , Util::Memory , Util::ParamComponent , Util::Tensor , Util::Vector
• insert() : Tools::TypeMap , Util::List< Data >
• insertNext() : Util::List< Data >
• insertPrev() : Util::List< Data >
• Int() : Util::Int
• IntDistribution() : Util::IntDistribution
• integrate() : Util::Polynomial< T >
• integrateStep1() : DdMd::NphIntegrator , DdMd::NptIntegrator , DdMd::NveIntegrator , DdMd::NvtIntegrator , DdMd::NvtLangevinIntegrator , DdMd::TwoStepIntegrator
• integrateStep2() : DdMd::NphIntegrator , DdMd::NptIntegrator , DdMd::NveIntegrator , DdMd::NvtIntegrator , DdMd::NvtLangevinIntegrator , DdMd::TwoStepIntegrator
• Integrator() : DdMd::Integrator
• integrator() : DdMd::Simulation
• IntegratorFactory() : DdMd::IntegratorFactory
• integratorFactory() : DdMd::Simulation
• interaction() : DdMd::AnglePotentialImpl< Interaction > , DdMd::BondPotentialImpl< Interaction > , DdMd::DihedralPotentialImpl< Interaction > , DdMd::ExternalPotentialImpl< Interaction > , DdMd::PairPotentialImpl< Interaction > , McMd::AnglePotentialImpl< Interaction > , McMd::BondPotentialImpl< Interaction > , McMd::DihedralPotentialImpl< Interaction > , McMd::ExternalPotentialImpl< Interaction > , McMd::LinkPotentialImpl< Interaction > , McMd::McExternalPerturbation< Interaction > , McMd::McPairPerturbation< Interaction > , McMd::McPairPotentialImpl< Interaction >
• interactionClassName() : DdMd::AnglePotential , DdMd::AnglePotentialImpl< Interaction > , DdMd::BondPotential , DdMd::BondPotentialImpl< Interaction > , DdMd::DihedralPotential , DdMd::DihedralPotentialImpl< Interaction > , DdMd::ExternalPotential , DdMd::ExternalPotentialImpl< Interaction > , DdMd::PairPotential , DdMd::PairPotentialImpl< Interaction > , McMd::AnglePotential , McMd::AnglePotentialImpl< Interaction > , McMd::BondPotential , McMd::BondPotentialImpl< Interaction > , McMd::DihedralPotential , McMd::DihedralPotentialImpl< Interaction > , McMd::ExternalPotential , McMd::ExternalPotentialImpl< Interaction > , McMd::LinkPotentialImpl< Interaction > , McMd::McPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::MdEwaldPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::MdPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::PairPotential
• InterIntraLink() : McMd::InterIntraLink
• interval() : DdMd::Analyzer , DdMd::Modifier , McMd::Analyzer , McMd::ReplicaMove , Tools::Analyzer
• interval_ : McMd::Analyzer
• IntraBondStressAutoCorr() : McMd::IntraBondStressAutoCorr< SystemType >
• IntraBondTensorAutoCorr() : McMd::IntraBondTensorAutoCorr< SystemType >
• IntraPairAutoCorr() : McMd::IntraPairAutoCorr
• IntraStructureFactor() : McMd::IntraStructureFactor
• IntraStructureFactorGrid() : McMd::IntraStructureFactorGrid
• IntVector() : Util::IntVector
• intVectors_ : McMd::CompositionProfile
• inverse() : Util::PointSymmetry
• ioCommunicator() : Util::MpiFileIo
• iOldPos_ : McMd::CfbDoubleRebridgeMove
• is_loading() : Util::BinaryFileIArchive , Util::BinaryFileOArchive , Util::MemoryCounter , Util::MemoryIArchive , Util::MemoryOArchive , Util::TextFileIArchive , Util::TextFileOArchive , Util::XdrFileIArchive , Util::XdrFileOArchive
• is_saving() : Util::BinaryFileIArchive , Util::BinaryFileOArchive , Util::MemoryCounter , Util::MemoryIArchive , Util::MemoryOArchive , Util::TextFileIArchive , Util::TextFileOArchive , Util::XdrFileIArchive , Util::XdrFileOArchive
• isActive() : McMd::Atom , McMd::Group< NAtom > , McMd::Link , Tools::Molecule , Util::Begin , Util::FlagSet , Util::ParamComposite , Util::Parameter
• isActive_ : Util::Parameter
• isAdiabatic() : Simp::EnergyEnsemble
• isAllocated() : DdMd::AtomArray , DdMd::Buffer , DdMd::CellList , DdMd::PairList , Tools::CellList , Util::ArraySet< Data > , Util::ArrayStack< Data > , Util::DArray< Data > , Util::DMatrix< Data > , Util::DPArray< Data > , Util::DRaggedMatrix< Data > , Util::DSArray< Data > , Util::GArray< Data > , Util::GPArray< Data > , Util::GridArray< Data > , Util::GStack< Data > , Util::MemoryIArchive , Util::MemoryOArchive , Util::RingBuffer< Data >
• isAtInterval() : DdMd::Analyzer , DdMd::Modifier , McMd::Analyzer , McMd::ReplicaMove , Tools::Analyzer
• isBack() : Util::ListIterator< Data >
• isBinary() : DdMd::TrajectoryWriter , McMd::TrajectoryWriter , Tools::TrajectoryReader , Tools::TrajectoryWriter
• isBinary_ : McMd::TrajectoryWriter
• isBlockComplete() : Util::Average , Util::SymmTensorAverage , Util::TensorAverage
• isBuilt() : DdMd::CellList , Tools::CellList
• isCartesian() : DdMd::AtomStorage
• isClear() : Util::Label
• isClosed() : Simp::SpeciesEnsemble
• isCommonControl() : Util::FileMaster
• isCopy() : McMd::System
• isCurrent() : McMd::PairList
• isElement() : Util::SSet< Data, Capacity >
• isEmpty() : McMd::System , McMd::SystemInterface
• isEnd() : DdMd::PairIterator , McMd::PairIterator , Util::ArrayIterator< Data > , Util::ConstArrayIterator< Data > , Util::ConstPArrayIterator< Data > , Util::ListIterator< Data >
• iSend() : Util::MemoryOArchive
• isEnd() : Util::PArrayIterator< Data > , Util::XmlBase
• isEnergySet() : DdMd::Potential
• isExchangeNeeded() : DdMd::Integrator
• isFirstStep_ : DdMd::StructureFactor , McMd::CompositionProfile , McMd::StructureFactor
• isFront() : Util::ListIterator< Data >
• isFull() : Util::RingBuffer< Data >
• isGhost() : DdMd::Atom
• isGhostCell() : DdMd::Cell
• isGrand() : Simp::SpeciesEnsemble
• isInDomain() : DdMd::Domain
• isInGrid() : Util::Grid , Util::GridArray< Data >
• isInitialized() : DdMd::AtomStorage , DdMd::Buffer , DdMd::Domain , McMd::PairList
• isInitialized_ : DdMd::OrderParamNucleation , DdMd::StructureFactor , DdMd::VanHove , McMd::CompositionProfile , McMd::MdCoulombPotential , McMd::StructureFactorP , McMd::TrajectoryWriter , Simp::LJPair
• isIoProcessor() : TestRunner , UnitTest , Util::MpiFileIo
• isIsobaric() : Simp::BoundaryEnsemble
• isIsothermal() : Simp::EnergyEnsemble
• isMasked() : DdMd::Mask , McMd::Mask
• isMaster() : DdMd::Domain
• isMatched() : Util::Label
• isMinImageCart() : Simp::OrthorhombicBoundary
• isMinImageGen() : Simp::OrthorhombicBoundary
• isMutable() : Simp::Species
• isPairListCurrent() : McMd::MdPairPotential
• isRequired() : Util::Begin , Util::Label , Util::ParamComposite , Util::Parameter
• isRigid() : Simp::BoundaryEnsemble
• isRunning() : Util::Timer
• isSet() : DdMd::Modifier , McMd::ColVar , Util::Bit , Util::Setable< T >
• isSetEnergy() : McMd::EwaldRSpaceAccumulator
• isSetStress() : McMd::EwaldRSpaceAccumulator
• isSetup() : DdMd::Integrator
• isStressSet() : DdMd::Potential
• iStep() : DdMd::Integrator , McMd::Simulation
• iStep_ : DdMd::Integrator , McMd::Simulation
• isValid() : DdMd::AtomMap , DdMd::AtomStorage , DdMd::CellList , DdMd::GroupExchanger , DdMd::GroupStorage< N > , DdMd::Potential , DdMd::Simulation , McMd::Cell , McMd::CellList , McMd::Cluster , McMd::ClusterIdentifier , McMd::LinkMaster , McMd::McSimulation , McMd::McSystem , McMd::MdSimulation , McMd::MdSystem , McMd::PairList , McMd::Simulation , McMd::System , Simp::MonoclinicBoundary , Simp::OrthoRegion , Simp::OrthorhombicBoundary , Simp::Species , Tools::CellList , Tools::Species , Util::ArraySet< Data > , Util::ArrayStack< Data > , Util::GStack< Data > , Util::List< Data > , Util::ListArray< Data > , Util::Setable< T > , Util::SymmetryGroup< Symmetry >