Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

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• makeAngle() : Simp::Species
• makeBond() : Simp::Species
• makeCompleteGroup() : Util::SymmetryGroup< Symmetry >
• makeDihedral() : Simp::Species
• makeGrid() : DdMd::CellList , Tools::CellList
• makeSnapshot() : DdMd::AtomStorage
• makeStar() : Util::PointGroup
• makeWaves() : McMd::MdCoulombPotential , McMd::MdEwaldPotential , McMd::MdSpmePotential
• makeWaveVectors() : DdMd::StructureFactor , DdMd::VanHove , McMd::CompositionProfile , McMd::StructureFactor , McMd::StructureFactorP
• Manager() : Util::Manager< Data >
• map() : DdMd::AtomStorage
• markGhosts() : DdMd::GroupExchanger , DdMd::GroupStorage< N >
• markSpanningGroups() : DdMd::GroupExchanger , DdMd::GroupStorage< N >
• mask() : DdMd::Atom
• Mask() : DdMd::Mask
• mask() : McMd::Atom
• Mask() : McMd::Mask
• mask() : Util::Bit
• maskedPairPolicy() : DdMd::Simulation , DdMd::SimulationAccess , McMd::Simulation
• mass() : DdMd::AtomType , McMd::AtomType
• match() : McMd::Command , McMd::PairSelector , Util::Label , Util::XmlAttribute , Util::XmlEndTag , Util::XmlXmlTag
• matchAttribute() : Util::XmlStartTag
• matchLabel() : Util::XmlStartTag
• matchStructure() : Simp::Species
• Matrix() : Util::Matrix< Data > , Util::PointSymmetry
• max() : Util::Distribution , Util::IntDistribution , Util::Memory
• max_ : Util::Distribution , Util::IntDistribution
• MaxAnglePerAtom : Simp::Species
• MaxAtomCell : McMd::Cell
• MaxAtomType : Simp::LJPair
• MaxBondPerAtom : Simp::Species
• maxBoundary() : McMd::System
• maxBoundary_ : DdMd::PairPotential
• maxDelay() : Util::AutoCorrelation< Data, Product >
• MaxDihedralPerAtom : Simp::Species
• maxId() : Util::Vector
• maxima_ : Simp::OrthoRegion
• maxNAtom() : DdMd::AtomStorage , DdMd::PairList , McMd::PairList
• MaxNCellCut : DdMd::Cell
• MaxNeighbor : McMd::CellList
• MaxNeighborAtom : DdMd::Cell , Tools::Cell
• maxNGhost() : DdMd::AtomStorage
• maxNGroup() : DdMd::GroupStorage< N >
• maxNPair() : DdMd::PairList , McMd::PairList
• maxPairCutoff() : DdMd::PairPotential , DdMd::PairPotentialImpl< Interaction > , McMd::McPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::MdEwaldPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::MdPairPotentialImpl< Interaction > , McMd::PairPotential , Simp::CompensatedPair< BarePair, LinkPotential > , Simp::DpdPair , Simp::LJPair
• maxPairCutoff_ : Simp::LJPair
• maxSqDisplacement() : DdMd::AtomStorage
• maxStageId_ : Util::AutoCorrStage< Data, Product >
• MaxTrial_ : McMd::CfbEndBase
• McAnalyzerFactory() : McMd::McAnalyzerFactory
• McAnalyzerManager() : McMd::McAnalyzerManager
• McBondEnergyAverage() : McMd::McBondEnergyAverage
• McCommandFactory() : McMd::McCommandFactory
• McCommandManager() : McMd::McCommandManager
• McConfigIo() : McMd::McConfigIo
• McCoulombPotential() : McMd::McCoulombPotential
• McDeformCommand() : McMd::McDeformCommand
• McEnergyAnalyzer() : McMd::McEnergyAnalyzer
• McEnergyAverage() : McMd::McEnergyAverage
• McEnergyOutput() : McMd::McEnergyOutput
• McEnergyPerturbation() : McMd::McEnergyPerturbation
• McExternalEnergyAverage() : McMd::McExternalEnergyAverage
• McExternalPerturbation() : McMd::McExternalPerturbation< Interaction >
• mcFactory() : McMd::PairFactory
• McIntraBondStressAutoCorr() : McMd::McIntraBondStressAutoCorr
• McIntraBondTensorAutoCorr() : McMd::McIntraBondTensorAutoCorr
• McMdConfigIo() : McMd::McMdConfigIo
• McMove() : McMd::McMove
• McMoveFactory() : McMd::McMoveFactory
• mcMoveFactory() : McMd::McSimulation
• McMoveManager() : McMd::McMoveManager
• mcMoveManager() : McMd::McSimulation
• McMuExchange() : McMd::McMuExchange
• McNVTChemicalPotential() : McMd::McNVTChemicalPotential
• McPairEnergyAverage() : McMd::McPairEnergyAverage
• McPairExternalPerturbation() : McMd::McPairExternalPerturbation< PairInteraction, ExternalInteraction >
• McPairPerturbation() : McMd::McPairPerturbation< Interaction >
• McPairPotential() : McMd::McPairPotential
• McPairPotentialImpl() : McMd::McPairPotentialImpl< Interaction >
• McPerturbationFactory() : McMd::McPerturbationFactory
• McPressureAverage() : McMd::McPressureAverage
• McSimulation() : McMd::McSimulation
• McStressAutoCorrelation() : McMd::McStressAutoCorrelation
• McSystem() : McMd::McSystem
• McSystemInterface() : McMd::McSystemInterface
• McVirialStressTensorAverage() : McMd::McVirialStressTensorAverage
• MdAnalyzerFactory() : McMd::MdAnalyzerFactory
• MdAnalyzerManager() : McMd::MdAnalyzerManager
• MdColVar() : McMd::MdColVar
• MdCommandFactory() : McMd::MdCommandFactory
• MdCommandManager() : McMd::MdCommandManager
• MdConfigIo() : McMd::MdConfigIo
• MdCoulombPotential() : McMd::MdCoulombPotential
• MdDeformCommand() : McMd::MdDeformCommand
• MdEnergyAnalyzer() : McMd::MdEnergyAnalyzer
• MdEwaldPairPotentialImpl() : McMd::MdEwaldPairPotentialImpl< Interaction >
• MdEwaldPotential() : McMd::MdEwaldPotential
• mdFactory() : McMd::PairFactory , McMd::SpecialFactory
• MdIntegrator() : McMd::MdIntegrator
• mdIntegrator() : McMd::MdSystem
• MdIntegratorFactory() : McMd::MdIntegratorFactory
• mdIntegratorFactory() : McMd::MdSystem
• MdIntraBondStressAutoCorr() : McMd::MdIntraBondStressAutoCorr
• MdIntraBondTensorAutoCorr() : McMd::MdIntraBondTensorAutoCorr
• MdKineticEnergyAverage() : McMd::MdKineticEnergyAverage
• MdMove() : McMd::MdMove
• MdPairEnergyCoefficients() : McMd::MdPairEnergyCoefficients
• MdPairPotential() : McMd::MdPairPotential
• MdPairPotentialImpl() : McMd::MdPairPotentialImpl< Interaction >
• MdPotentialEnergyAverage() : McMd::MdPotentialEnergyAverage
• MdSimulation() : McMd::MdSimulation
• MdSpmePotential() : McMd::MdSpmePotential
• MdStressAutoCorr() : McMd::MdStressAutoCorr
• MdSystem() : McMd::MdSystem
• MdSystemInterface() : McMd::MdSystemInterface
• MdVirialStressTensorAverage() : McMd::MdVirialStressTensorAverage
• MemoryCounter() : Util::MemoryCounter
• MemoryIArchive() : Util::MemoryIArchive
• MemoryOArchive() : Util::MemoryOArchive
• message() : TestException , Util::Exception
• message_ : TestException , Util::Exception
• method() : UnitTestRunner< UnitTestClass >
• MethodFunctor() : Util::MethodFunctor< Object, T > , Util::MethodFunctor< Object, void >
• methodId() : DdMd::PairPotential
• MethodPtr : UnitTestRunner< UnitTestClass >
• metropolis() : Util::Random
• min() : Util::Distribution , Util::IntDistribution
• min_ : Util::Distribution , Util::IntDistribution
• minId() : Util::Vector
• minima_ : Simp::OrthoRegion
• minLength() : Simp::MonoclinicBoundary , Simp::OrthorhombicBoundary
• mode() : McMd::NphIntegrator
• mode_ : McMd::Perturbation
• modes_ : DdMd::StructureFactor , McMd::StructureFactor
• modId() : McMd::RingOctaRebridgeMove , McMd::RingTetraRebridgeMove
• Modifier() : DdMd::Modifier
• ModifierFactory() : DdMd::ModifierFactory
• ModifierManager() : DdMd::ModifierManager
• modifierManager() : DdMd::Simulation
• modifySignal() : DdMd::Simulation
• molecule() : McMd::Atom , McMd::ClusterLink
• Molecule() : McMd::Molecule
• molecule() : McMd::System
• Molecule() : Tools::Molecule
• molecule() : Tools::Species
• moleculeCapacity() : McMd::Simulation
• moleculeCapacity_ : Simp::Species
• moleculeEnergy() : McMd::McPairPotential , McMd::McPairPotentialImpl< Interaction >
• moleculeId : DdMd::AtomContext , McMd::System , Tools::Atom
• MoleculeIterator : McMd::System
• MoleculeSet : McMd::System
• moleculeStateId() : McMd::SpeciesMutator
• momentTensor() : McMd::Cluster
• MonoclinicBoundary() : Simp::MonoclinicBoundary
• monomial() : Util::Polynomial< T >
• move() : McMd::AtomDisplaceMove , McMd::CfbDoubleRebridgeMove , McMd::CfbEndMove , McMd::CfbLinearEndMove , McMd::CfbRebridgeMove , McMd::CfbReptateMove , McMd::CfbReptationMove , McMd::CfbRingRebridgeMove , McMd::DpdMove , McMd::EndSwapMove , McMd::GcSliplinkMove , McMd::HomopolymerSemiGrandMove , McMd::HybridMdMove , McMd::HybridNphMdMove , McMd::McMove , McMd::MdMove , McMd::ReplicaMove , McMd::RigidDisplaceMove , McMd::RingOctaRebridgeMove , McMd::RingTetraRebridgeMove , McMd::Sliplinker , McMd::SliplinkerAll , McMd::SliplinkerEnd , McMd::SliplinkMove
• moveAtom() : McMd::McPairPotential
• MpiFileIo() : Util::MpiFileIo
• MpiLoader() : Util::MpiLoader< IArchive >
• MpiLogger() : Util::MpiLogger
• MpiStructBuilder() : Util::MpiStructBuilder
• MTRand_int32() : Util::MTRand_int32
• mu() : Simp::SpeciesEnsemble
• Multiblock() : Simp::Multiblock
• MultiHarmonicDihedral() : Simp::MultiHarmonicDihedral
• multiply() : Util::IntVector , Util::Tensor , Util::Vector
• mutator() : Simp::Species